根据《中华人民共和国政府采购法》第三十五条货物和服务项目实行招标方式采购的，自招标文件开始发出之日起至投标人提交投标文件截止之日止，不得少于二十日。（采购法中只针对项目实行招标方式采购的有提交投标文件截止时间有要求，本项目不属于招标类采购，故“B．谈判文件发布后12日提交投标文件违反了‘招投标类采购自招标文件发出之日起至投标人提交投标文件截止之日止，不得少于20天’的要求。”是错误的。）
    第三十八条采用竞争性谈判方式采购的，应当遵循下列程序：
    （一）成立谈判小组。谈判小组由采购人的代表和有关专家共三人以上的单数组成，其中专家的人数不得少于成员总数的三分之二。 （本题目中的谈判小组共5人，技术专家3人，技术专家不足2/3，故“ D．谈判小组人员组成不合理”是正确的。）
    （二）制定谈判文件。谈判文件应当明确谈判程序、谈判内容、合同草案的条款以及评定成交的标准等事项。 （采购法中没有规定谈判文件的制定方，故“A．该部门不应自行编制谈判文件，应委托中介机构编制”是错误的。）
    （三）确定邀请参加谈判的供应商名单。谈判小组从符合相应资格条件的供应商名单中确定不少于三家的供应商参加谈判，并向其提供谈判文件。 （故“C．应邀请3家以上（不含3家）IT厂商参与谈判”是错误的。）
    （四）谈判。谈判小组所有成员集中与单一供应商分别进行谈判。在谈判中，谈判的任何一方不得透露与谈判有关的其他供应商的技术资料、价格和其他信息。谈判文件有实质性变动的，谈判小组应当以书面形式通知所有参加谈判的供应商。
    （五）确定成交供应商。谈判结束后，谈判小组应当要求所有参加谈判的供应商在规定时间内进行最后报价，采购人从谈判小组提出的成交候选人中根据符合采购需求、质量和服务相等且报价最低的原则确定成交供应商，并将结果通知所有参加谈判的未成交的供应商。
    因此本题目的正确答案是D。